Manajemen
Dalam upaya mencapai visi dan misinya, Pesantren MAQI memiliki struktur organisasi yang efektif dan efisien dalam rangka menjalankan roda organisasi secara transparan dan akuntabel. Berikut adalah struktur organisasi Pesantren MAQI:
Pembina
Pembina adalah badan tertinggi di Pesantren yang mewakili kepentingan Yayasan Amal Mata Hati, masyarakat umum dan kepentingan Pesantren itu sendiri. Tugas Pembina adalah menetapkan kebijakan umum Pesantren, mengangkat/memberhentikan pimpinan Pesantren, melaksanakan fungsi pengawasan dan pengendalian umum atas pengelolaan Pesantren dan melakukan penilaian kinerja pimpinan Pesantren.
Pelaksana Akademik
Pelaksana Akademik adalah unsur pelaksana akademik yang berfungsi menjalankan fungsi pengelolaan Pesantren.
Pelaksana Administrasi
Pelaksana Administrasi adalah bagian vital dan esensial bagi Ma’had untuk menjalankan sistem administrasi dan organisasi Pesantren.
Susunan organisasi Pesantren MAQI adalah sebagai berikut:
Pembina :
Ketua Yayasan Amal Mata Hati
Ustadz Kurnia Lirahmat
Pelaksana Akademik
Direktur :
Ustadz Wildan Risalat
Wakil Direktur :
Ustadz Sihabudin
Bagian Kurikulum dan Akademik :
Ustadz Paisal Ahmad Akbar
Bagian Kesantrian, Dakwah dan Ekstrakurikuler:
Ustadz Nurfalah
Pelaksana Administrasi
Ustadz Fairuuz Faatin